Subsidie voor haalbaarheidsprojecten wordt meteen ambtshalve vastgesteld en controle van de prestaties wordt steekproefsgewijs gedaan. De aanvrager dient een activiteitenverslag aan te leveren als daarom wordt gevraagd.

Subsidie voor R&D samenwerkingsprojecten dient verantwoord te worden op basis van werkelijk gemaakte kosten. Begunstigden dienen een aanvraag tot vaststelling in te dienen en daarbij een activiteitenverslag en een financieel verslag bij te voegen. Indien volgens de subsidieverleningsbeschikking de verleende subsidie aan een afzonderlijke deelnemer aan het R&D-samenwerkingsproject € 125.000 of meer bedraagt , dan moet de aanvrager voor de betreffende deelnemer(s) ook een controleverklaring aanleveren. Naast deze eindrapportage is eenmalig ook een voortgangsrapportage verplicht.